Bloque 2 Modelos más avanzados
Parte 2 Modelos N-mixture (N-mezclas)

IREC, 14/05/2024
Javier Fernández-López, Valentin Lauret
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En el menú…

  • Día 1:
    • Modelos Generalizados Lineales con R: Distribuciones de probabilidad, programación básica, simulaciones y modelos en ecología.
    • Intrducción al análisis Bayesiano con NIMBLE: Inferencia Bayesiana, NIMBLE y modelos en ecología
  • Día 2:
    • Modelos de ocupación: Detectabilidad imperfecta y probabilidad de presencia
    • Modelos N-mixture: Detectabilidad imperfecta y abundancia
    • Modelos de Captura-Recaptura espaciales (SCR)
  • Día 3:
    • Caso de estudio con Pepe Jiménez
    • Trabajo personal con datos propios

Modelos N-mixture

  • Podría decirse que son la versión de los modelos de ocupación para abundancias (conteos repetidos)
  • Los conteos son “baratos” en comparación con el marcaje y recaptura
  • No requieren de información complementaria como la distancia, etc.
  • Tienen algunas controversias: Barker et al. (2017), Kery (2017), Link et al. (2018)

Modelos N-mixture

\[\begin{equation} N_i \sim Poisson(\lambda_i) \end{equation}\] \[\begin{equation} log(\lambda_i) = \beta_0 + \beta_1X1_i \end{equation}\]

Modelos N-mixture

\[\begin{equation} N_i \sim Poisson(\lambda_i) \end{equation}\] \[\begin{equation} log(\lambda_i) = \beta_0 + \beta_1X1_i \end{equation}\]

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\[\begin{equation} C_{ij}|N_i \sim Binomial(N_i,p_{ij}) \end{equation}\] \[\begin{equation} logit(p_{ij}) = \alpha_0 + \alpha_1X2_{ij} \end{equation}\]

Modelos N-mixture

  • La abundancia de un sitio no varía durante el periodo de estudio (población cerrada, no hay muertes, nacimientos ni migración)
  • Las distribuciones utilizadas (Poisson y binomial) son las adecuadas
  • La abundancia en cada sitio es independiente del resto de sitios
  • No hay dobles conteos
  • Todos los individuos tienen la misma probabilidad de detección
  • No hay heterogeneidad no modelada

Para ampliar

Taller Ocupación y N-mixture (frecuentista)

Tutorial N-mixture (frecuentista)

Nota breve teórico-práctica sobre integración de datos con NIMBLE \[~\]

Vuestro turno!